Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMTK3Q96Q04 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMTK3Q96Q04 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms