Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC7Q96NW7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms