Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD6Q96NK8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms