Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM20AQ96MK3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms