Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms