Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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SAMD8Q96LT4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SAMD8Q96LT4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SAMD8Q96LT4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SAMD8Q96LT4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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