Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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KCNS1Q96KK3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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KCNS1Q96KK3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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KCNS1Q96KK3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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KCNS1Q96KK3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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KCNS1Q96KK3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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KCNS1Q96KK3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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