Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms