Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRIQ1Q96JM4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
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