Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMX3Q96JJ7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms