Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM46AQ96IP4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM46AQ96IP4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM46AQ96IP4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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