Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM17Q96I25 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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