Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms