Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPDL1Q96EA4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms