Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C18orf8Q96DM3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms