Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RNF183Q96D59 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RNF183Q96D59 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RNF183Q96D59 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RNF183Q96D59 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms