Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms