Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms