Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A3Q93084 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A3Q93084 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms