Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP13Q92995 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP13Q92995 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP13Q92995 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP13Q92995 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP13Q92995 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP13Q92995 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP13Q92995 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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