Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRF1Q92994 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms