Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLP1Q92989 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLP1Q92989 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms