Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CELF1Q92879 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms