Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN4Q92575 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms