Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms