Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C15orf40Q8WUR7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C15orf40Q8WUR7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms