Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms