Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3C3Q8NEB9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms