Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms