Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM35BQ8NCS4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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