Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms