Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms