Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms