Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC63Q8NA47 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms