Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms