Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms