Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC117Q8IWD4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms