Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms