Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC84Q86UT8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC84Q86UT8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms