Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLNKQ7Z7G1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms