Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms