Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDXQ7Z353 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDXQ7Z353 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDXQ7Z353 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDXQ7Z353 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDXQ7Z353 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms