Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms