Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms