Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFVQ71UI9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms