Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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