Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L3Q6VB84 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms