Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXU4

GSG1L, Germ cell-specific gene 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1LQ6UXU4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSG1LQ6UXU4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms