Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms