Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms