Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
REEP3Q6NUK4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms